978-5-907561-33-5 10.31483/a-10364 Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии chief_editor Антонова Елена Ивановна Antonova Elena Ivanovna https://orcid.org/0000-0002-3686-9686 antonov_67@mail.ru Ленгесова Наталья Анатольевна Lengesova Natal'ia Anatol'evna https://orcid.org/0000-0001-7512-6386 lengesova@yandex.ru Антонова Елена Ивановна Antonova Elena Ivanovna https://orcid.org/0000-0002-3686-9686 Антонова Елена Ивановна Antonova Elena Ivanovna https://orcid.org/0000-0002-3686-9686 Ленгесова Наталья Анатольевна Lengesova Natal'ia Anatol'evna https://orcid.org/0000-0001-7512-6386 Беззубенкова Ольга Евгеньевна Bezzubenkova Ol'ga Evgen'evna https://orcid.org/0000-0002-3243-6381 Коняев Игорь Сергеевич Koniaev Igor' Sergeevich Масленников Андрей Викторович Maslennikov Andrei Viktorovich https://orcid.org/0000-0002-1421-7484 Куницына Анастасия Владимировна Khambikova Anastasiia Vladimirovna Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии Fundamental and applied research for key propriety areas of bioecology and biotechnology 20 05 2022 Ульяновск ИД «Среда» 2022 Copyright © Shaimaa Hamza, Ekaterina E. Garanina, Ekaterina V. Martynova, Maria I. Markelova, Jurij N. Davidyuk, Venera G. Shakirova, Svetlana F. Khaibullina, 2022 2022 This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License. 10.31483/r-102484 102484 Antibody Immune Responses to SARS-CoV-2 Peptides in COVID-19 Convalescent Patients Иммунные реакции антител к пептидам SARS-CoV-2 у выздоравливающих пациентов с COVID-19 Хамза Шаймаа Hamza Shaimaa shaimaa.hamza@mail.ru Гаранина Екатерина Евгеньевна Garanina Ekaterina Evgenevna Мартынова Екатерина Владимировна Martynova Ekaterina Vladimirovna ignietferro.venivedivici@gmail.com Маркелова Мария Ивановна Markelova Maria Ivanovna Давидюк Юрий Николаевич Davidyuk Jurij Nikolaevich Шакирова Венера Гусмановна Shakirova Venera Gusmanovna Хайбуллина Светлана Францевна Khaibullina Svetlana Frantsevna Институт фундаментальной медицины и биологии ФГАОУ ВО «Казанский (Приволжский) федеральный университет» Россия Institut fundamental'noi meditsiny i biologii FGAOU VO "Kazanskii (Privolzhskii) federal'nyi universitet" Russia 05256ym39 Казанский (Приволжский) федеральный университет Россия 05256ym39 Kazan Federal University Russia Казанская государственная медицинская академия – филиал ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия последипломного образования» Министерства здравоохранения Российской Федерации Россия Kazanskaia gosudarstvennaia meditsinskaia akademiia - filial FGBOU DPO "Rossiiskaia meditsinskaia akademiia poslediplomnogo obrazovaniia" Ministerstva zdravookhraneniia Rossiiskoi Federatsii Russia 220 225

identifying immunogenic targets of SARS-CoV-2 is essential to develop novel treatments. The authors of the article studied humoral immune responses to spike (S) and nucleocapsid (N) SARS-CoV-2 proteins in serum from convalescent COVID-19 patients from Tatarstan, Russia. Multiple SARS-CoV-2 peptides were identified as reacting with convalescent COVID-19 serum. In addition, age and gender associated differences in the reactivity to S and N protein peptides were identified. Changing pattern of immunogenic peptide reactivity in COVID-19 serum based on age and gender was demonstrated. These data highlight how humoral immune responses to some of these peptides could contribute to SARS-CoV-2 pathogenesis.

выявление иммуногенных мишеней коронавируса SARS-CoV-2 имеет решающее значение для совершенствования стратегий диагностики и борьбы с заболеванием. Авторы статьи проанализировали гуморальный (ИФА) иммунный ответй на спайковый (S) и нуклеокапсидный (N) белки SARS-CoV-2 в сыворотке крови выздоравливающих пациентов с COVID-19 из Татарстана, Россия. В сыворотке крови выздоравливающих от COVID-19 были идентифицированы множественные пептиды SARS-CoV-2. Кроме того, были выявлены возрастные и гендерные различия в реактивности к S- и N-белковым пептидам. Таким образом, в исследовании была продемонстрирована изменяющаяся картина реактивности иммуногенных пептидов в сыворотке COVID-19 в зависимости от возраста и пола. Полученные данные показывают, как гуморальные иммунные реакции на некоторые из коронавирусных пептидов могут способствовать патогенезу COVID-19.

 COVID-19 SARS-CoV-2 спайковый белок пептиды антитела гуморальный иммунный ответ COVID-19 SARS-CoV-2 spike protein peptides antibody humoral immune response This study was supported by the subsidy allocated to Kazan Federal University for the state assignment in science (project #0671-2020-0058). This work is part of Kazan Federal University Strategic Academic Leadership Program. 501100012528 #0671-2020-0058 Kazan Federal University References W.H.O. Pneumonia of unknown cause - China. 2020; Available from: https://www.who.int/csr/don/05-january-2020-pneumonia-of-unkown-cause-china/en/. https://www.who.int/csr/don/05-january-2020-pneumonia-of-unkown-cause-china/en/ The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2. Nat Microbiol, 2020. 5(4): p. 536-544. Grasselli, G., et al., Pathophysiology of COVID-19-associated acute respiratory distress syndrome–Authors' reply. The Lancet Respiratory Medicine, 2021. 9(1): p. e5-e6. Grasselli G. Hu, W.T., et al., Early Release-Antibody Profiles According to Mild or Severe SARS-CoV-2 Infection, Atlanta, Georgia, USA, 2020. Hu W. T. Sun, B., et al., Kinetics of SARS-CoV-2 specific IgM and IgG responses in COVID-19 patients. Emerging microbes & infections, 2020. 9(1): p. 940-948. Sun B. Roltgen, K., et al., Defining the features and duration of antibody responses to SARS-CoV-2 infection associated with disease severity and outcome. Sci Immunol, 2020. 5(54). Roltgen K. Grifoni, A., et al., A sequence homology and bioinformatic approach can predict candidate targets for immune responses to SARS-CoV-2. Cell host & microbe, 2020. 27(4): p. 671-680. e2. Grifoni A. Vita, R., et al., The immune epitope database (IEDB): 2018 update. Nucleic acids research, 2019. 47(D1): p. D339-D343. Vita R. Dessau, R.B. and C.B. Pipper, ''R"–project for statistical computing. Ugeskrift for laeger, 2008. 170(5): p. 328-330. Dessau R. B. Liang, Y., et al., Comprehensive antibody epitope mapping of the nucleocapsid protein of severe acute respiratory syndrome (SARS) coronavirus: insight into the humoral immunity of SARS. Clinical chemistry, 2005. 51(8): p. 1382-1396. Liang Y. Flemming, A., Deciphering the protective features of the antibody response. Nature Reviews Immunology, 2021: p. 1-1. Flemming A. Zhang, X., et al., Viral and Antibody Kinetics of COVID-19 Patients with Different Disease Severities in Acute and Convalescent Phases: A 6-Month Follow-Up Study. Virologica Sinica, 2020: p. 1-10. Zhang X. Garanina E., Shaimaa Hamza, Robert J. Stott-Marshall, Ekaterina Martynova, Maria Markelova, Yuriy Davidyuk, Venera Shakirova, Neha Kaushal, Manoj Baranwal, Ilsiyar M. Khaertynova, Albert Rizvanov, Toshana L. Foster, Svetlana Khaiboullina. Antibody and T Cell Immune Responses to SARS-CoV-2 Peptides in COVID-19 Convalescent Patients. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC90581 Garanina E. Robert J. Ilsiyar M. Toshana L. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC90581