978-5-907830-38-7 10.31483/a-10590 Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии Fundamental and applied research for key propriety areas of bioecology and biotechnology

В сборнике представлены статьи участников VII Всероссийской научно-практической конференции «Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии». В материалах сборника приведены результаты теоретических и прикладных изысканий представителей научного и образовательного сообщества в области биологии и медицины.

 chief_editor Антонова Елена Ивановна Antonova Elena Ivanovna https://orcid.org/0000-0002-3686-9686 antonov_67@mail.ru Ленгесова Наталья Анатольевна Lengesova Natal'ia Anatol'evna https://orcid.org/0000-0001-7512-6386 lengesova@yandex.ru Антонова Елена Ивановна Antonova Elena Ivanovna https://orcid.org/0000-0002-3686-9686 Антонова Елена Ивановна Antonova Elena Ivanovna https://orcid.org/0000-0002-3686-9686 Ленгесова Наталья Анатольевна Lengesova Natal'ia Anatol'evna https://orcid.org/0000-0001-7512-6386 Беззубенкова Ольга Евгеньевна Bezzubenkova Ol'ga Evgen'evna https://orcid.org/0000-0002-3243-6381 Коняев Игорь Сергеевич Koniaev Igor' Sergeevich Масленников Андрей Викторович Maslennikov Andrei Viktorovich https://orcid.org/0000-0002-1421-7484 Куницына Анастасия Владимировна Khambikova Anastasiia Vladimirovna Фирсова Наталья Викторовна Firsova Natalia Viktorovna https://orcid.org/0000-0002-9907-8857 Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии Fundamental and applied research for key propriety areas of bioecology and biotechnology 28 05 2024 Ульяновск ИД «Среда» 2024 Copyright © Насыров Т. Р., Давидюк Ю. Н., 2024 2024 This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License. 10.31483/r-111921 111921 Особенности генома штаммов Orthohantavirus puumalaense, выявленных в Рыбно-Слободском районе Республики Татарстан Osobennosti genoma shtammov Orthohantavirus puumalaense, vyiavlennykh v Rybno-Slobodskom raione Respubliki Tatarstan Насыров Тимур Радикович Nasyrov Timur Radikovich Давидюк Юрий Николаевич Davidiuk Iurii Nikolaevich davi.djuk@mail.ru 05256ym39 Казанский (Приволжский) федеральный университет Россия 05256ym39 Kazan Federal University Russia Научно-клинический центр прецизионной и регенеративной медицины ФГАОУ ВО «Казанский (Приволжский) федеральный университет» Россия Nauchno-klinicheskii tsentr pretsizionnoi i regenerativnoi meditsiny FGAOU VO "Kazanskii (Privolzhskii) federal'nyi universitet" Russia 68 75

проведены сравнительный и филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей отдельных сегментов генома штаммов Orthohantavirus puumlaense из Рыбно-Слободского района Республики Татарстан. Установлено, что исследованные штаммы наиболее близкородственны штаммам из Мамадышского района, вместе с ними образуют отдельную группу в Предкамье, варианты генома которой, вероятно, имеют гибридное происхождение.

 геморрагическая лихорадка с почечным синдромом S-сегмент M-сегмент вариабельность генома Orthohantavirus puumlaense L-сегмент рекомбинация реассортация Работа выполнена в рамках Программы стратегического академического лидерства Казанского (Приволжского) федерального университета (ПСАЛ–2030). References Blinova E. A fatal case of haemorrhagic fever with renal syndrome in Kursk Region, Russia, caused by a novel Puumala virus clade / E. Blinova, A. Deviatkin, S. Kurashova [et al.] // Journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases. – 2022. – V. 102. – A. 105295. DOI 10.1016/j.meegid.2022.105295. EDN NCOMTU Blinova E. Deviatkin A. Kurashova S. A fatal case of haemorrhagic fever with renal syndrome in Kursk Region, Russia, caused by a novel Puumala virus clade Journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases 2022 102 10.1016/j.meegid.2022.105295 NCOMTU Blinova E. Evolutionary Formation and Distribution of Puumala Virus Genome Variants, Russia / E. Blinova, A. Deviatkin, M. Makenov [et al.] // Emerging infectious diseases. – 2023. – V. 29. – P. 1420–1424. DOI 10.3201/eid2907.221731. EDN BOADFE Blinova E. Deviatkin A. Makenov M. Evolutionary Formation and Distribution of Puumala Virus Genome Variants, Russia Emerging infectious diseases 2023 29 1420 1424 10.3201/eid2907.221731 BOADFE Castel G. Phylogeography of Puumala orthohantavirus in Europe / G. Castel, F. Chevenet, M. Razzauti [et al.] // Viruses. – 2019. – V. 11. – A. 679. DOI 10.3390/v11080679. EDN YYRSDB Castel G. Chevenet F. Razzauti M. Phylogeography of Puumala orthohantavirus in Europe Viruses 2019 11 10.3390/v11080679 YYRSDB Davidyuk Y. Prevalence of the Puumala orthohantavirus Strains in the Pre-Kama Area of the Republic of Tatarstan, Russia / Y. Davidyuk, A. Shamsutdinov, E. Kabwe [et al.] // Pathogenes. – 2020. – Vol. 9. – Art. 540. Davidyuk Y. Shamsutdinov A. Kabwe E. Prevalence of the Puumala orthohantavirus Strains in the Pre-Kama Area of the Republic of Tatarstan, Russia Pathogenes 2020 9 Davidyuk Y. The Distribution of Puumala orthohantavirus Genome Variants Correlates with the Regional Landscapes in the Trans-Kama Area of the Republic of Tatarstan / Y. Davidyuk, E. Kabwe, A. Shamsutdinov [et al.] // Pathogenes. – 2021. – V. 10. – A.1169. Davidyuk Y. Kabwe E. Shamsutdinov A. The Distribution of Puumala orthohantavirus Genome Variants Correlates with the Regional Landscapes in the Trans-Kama Area of the Republic of Tatarstan Pathogenes 2021 10 Dekonenko A. Genetic similarity of Puumala viruses found in Finland and western Siberia and of the mitochondrial DNA of their rodent hosts suggests a common evolutionary origin / A. Dekonenko, V. Yakimenko, A. Ivanov [et al.] // Infection, genetics and evolution: journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases. – 2003. – V. 3. – P. 245–257. DOI 10.1016/S1567-1348(03)00088-1. EDN LHXOQX Dekonenko A. Yakimenko V. Ivanov A. Genetic similarity of Puumala viruses found in Finland and western Siberia and of the mitochondrial DNA of their rodent hosts suggests a common evolutionary origin Infection, genetics and evolution: journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases 2003 3 245 257 10.1016/S1567-1348(03)00088-1 LHXOQX Kabwe E. Analysis of Puumala orthohantavirus Genome Variants Identified in the Territories of Volga Federal District / E. Kabwe, W.Al Sheikh, A.F. Shamsutdinov [et al.] // Tropical Medicine and Infectious Disease. – 2022. – V.7,3. – A.46. DOI 10.3390/tropicalmed7030046. EDN OWBQNB Kabwe E. Shamsutdinov A. F. Analysis of Puumala orthohantavirus Genome Variants Identified in the Territories of Volga Federal District Tropical Medicine and Infectious Disease 2022 7 10.3390/tropicalmed7030046 OWBQNB Kabwe E. Orthohantaviruses, Emerging Zoonotic Pathogens / E. Kabwe, Y. Davidyuk, A. Shamsutdinov [et al.] // Pathogens. – 2020. – V. 9. – A.775. DOI 10.3390/pathogens9090775. EDN VKOBXG Kabwe E. Orthohantaviruses, Emerging Zoonotic Pathogens 10.3390/pathogens9090775 VKOBXG Kabwe E. Puumala Orthohantavirus Reassortant Genome Variants Likely Emerging in the Watershed / E. Kabwe, A.F. Shamsutdinov, S. Suleimanova [et al.] // Frontiers in bioengineering and biotechnology. – 2023. – V.24. – A.1018. Kabwe E. Shamsutdinov A. F. Suleimanova S. Puumala Orthohantavirus Reassortant Genome Variants Likely Emerging in the Watershed Frontiers in bioengineering and biotechnology 2023 24 Kariwa H. Epidemiological study of hantavirus infection in the Samara Region of European Russia / H. Kariwa, E.A. Tkachenko, V.G. Morozov [et al.] // The Journal of veterinary medical science. – 2009. – V. 71. – P. 1569–1578. DOI 10.1292/jvms.001569. EDN MWWRJH Kariwa H. Tkachenko E. A. Morozov V. G. Epidemiological study of hantavirus infection in the Samara Region of European Russia The Journal of veterinary medical science 2009 71 1569 1578 10.1292/jvms.001569 MWWRJH Martin D.P. RDP4: Detection and analysis of recombination patterns in virus genomes / D.P. Martin, B. Murrell, M. Golden [et al.] // Virus Evolution. – 2015. – V.1. – I.1. Martin D. P. Murrell B. Golden M. RDP4: Detection and analysis of recombination patterns in virus genomes Virus Evolution 2015 1 Razzauti M. Analysis of Puumala hantavirus in a bank vole population in northern Finland: evidence for co-circulation of two genetic lineages and frequent reassortment between strains / M. Razzauti, A. Plyusnina, T. Sironen [et al.] // The Journal of general virology. – 2009. – V. 90. – P. 1923–1931. DOI 10.1099/vir.0.011304-0. EDN XXJCEK Razzauti M. Plyusnina A. Sironen T. Analysis of Puumala hantavirus in a bank vole population in northern Finland: evidence for co-circulation of two genetic lineages and frequent reassortment between strains The Journal of general virology 2009 90 1923 1931 10.1099/vir.0.011304-0 XXJCEK Tamura K. Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees / K. Tamura, M. Nei // Molecular Biology and Evolution. – 1993. – V.10. – P. 512–526. EDN ITKNLD Tamura K. Nei M. Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees Molecular Biology and Evolution 1993 10 512 526 ITKNLD Tamura K. MEGA11: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 11 / K. Tamura, G. Strecher, S. Kumar // Molecular Biology and Evolution. – 2021. – V.38. – P. 3022–3027. Tamura K. Strecher G. Kumar S. MEGA11: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 11 Molecular Biology and Evolution 2021 38 3022 3027 Блинова Е.А. Генетические особенности вируса Пуумала (Hantaviridae: Orthohantavirus), обнаруженного в Московской области / Е.А. Блинова, М.Т. Макенов, Е.С. Морозкин [и др.] // Вопросы вирусологии. – 2023. – №68. – С. 283–290. DOI 10.36233/0507-4088-177. EDN NUUNOK Блинова Е. А. Макенов М. Т. Морозкин Е. С. Генетические особенности вируса Пуумала (Hantaviridae: Orthohantavirus), обнаруженного в Московской области Вопросы вирусологии 2023 68 283 290 10.36233/0507-4088-177 NUUNOK Елбоева П.И. Молекулярно-генетический анализ нуклеотидных последовательностей генома Puumala orthohantavirus, выявленных в Республике Мордовия / П.И. Елбоева, Ю.Н. Давидюк // Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии. – 2023. – С. 57–65. DOI 10.31483/r-106903. EDN WPSFEI Елбоева П. И. Давидюк Ю. Н. Молекулярно-генетический анализ нуклеотидных последовательностей генома Puumala orthohantavirus, выявленных в Республике Мордовия 57 65 10.31483/r-106903 WPSFEI Краснов Я.М. Филогенетический анализ вариантов вируса Пуумала (Hantaviridae: Orthohantavirus), циркулирующих на территории Саратовской области / Я.М. Краснов, Е.В. Найденова, Н.П. Гусева [и др.] // Вопросы вирусологии. – 2024. – №69. – С. 162–174. Краснов Я. М. Найденова Е. В. Гусева Н. П. Филогенетический анализ вариантов вируса Пуумала (Hantaviridae: Orthohantavirus), циркулирующих на территории Саратовской области Вопросы вирусологии 2024 69 162 174 Насыров Т.Р. Анализ генома штаммов Puumala orthohantavirus, выявленных в Бавлинском районе Республики Татарстан / Т.Р. Насыров, Ю.Н. Давидюк // Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии. – 2023. – С. 74–80. DOI 10.31483/r-106792. EDN AREWFO Насыров Т. Р. Давидюк Ю. Н. Анализ генома штаммов Puumala orthohantavirus, выявленных в Бавлинском районе Республики Татарстан 74 80 10.31483/r-106792 AREWFO Савицкая Т.А. Хантавирусные болезни: обзор эпидемиологической ситуации в мире. Анализ эпидемиологической ситуации по геморрагической лихорадке с почечным синдромом в российской Федерации в 2023 г. и прогноз на 2024 г. / Т.А. Савицкая, А.В. Иванова, А.А. Зубова [и др.] // Проблемы особо опасных инфекций. – 2023. – №1. – С. 113–124. Савицкая Т. А. Иванова А. В. Зубова А. А. Хантавирусные болезни: обзор эпидемиологической ситуации в мире. Анализ эпидемиологической ситуации по геморрагической лихорадке с почечным синдромом в российской Федерации в г. и прогноз на 2024 г. Проблемы особо опасных инфекций 2023 1 113 124 Яшина Л.Н. Возбудитель вспышки ГЛПС в Саратовской области, 2019 г. / Л.Н. Яшина, Т.В. Трегубчак, Б.С. Малышев [и др.] // Проблемы особо опасных инфекций. – 2021. – №4. – С. 150–156. DOI 10.21055/0370-1069-2021-4-150-156. EDN DXXSEY Яшина Л. Н. Трегубчак Т. В. Малышев Б. С. Возбудитель вспышки ГЛПС в Саратовской области, 2019 г. Проблемы особо опасных инфекций 2021 4 150 156 10.21055/0370-1069-2021-4-150-156 DXXSEY