Молекулярно-генетический анализ последовательности гена ENV вируса иммунодефицита человека на территории Республики Татарстан

Статья в сборнике трудов конференции
DOI: 10.31483/r-106993
Open Access
VI Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии»
Creative commons logo
Опубликовано в:
VI Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии»
Автор:
Андреева Н. Ю. 1 , Кабве Э. 1 , Давидюк Ю. Н. 2
Рубрика:
Молекулярная биология, генетика, микробиология
Страницы:
50-57
Получена: 26.05.2023

Рейтинг:
Статья просмотрена:
769 раз
Размещено в:
РИНЦ
1 Хусан (Атăл тăрăх) федераци университечĕ
2 Институт фундаментальной медицины и биологии ФГАОУ ВО «Казанский (Приволжский) федеральный университет»
Для цитирования:
Андреева Н. Ю. Молекулярно-генетический анализ последовательности гена ENV вируса иммунодефицита человека на территории Республики Татарстан: сборник трудов конференции. / Н. Ю. Андреева, Э. Кабве, Ю. Н. Давидюк // Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии : материалы VI Всерос. науч.-практич. конф. с международным участием (Ульяновск, May 22, 2023) / editorial board: Е. И. Антонова [etc.] – Чебоксары: «Лару-тăру» («Среда») издательство çурчě, 2023. – pp. 50-57. – ISBN 978-5-907688-37-7. – DOI 10.31483/r-106993.

Аннотаци

Генетическая гетерогенность ВИЧ влияет на патогенность вируса, прогрессирование заболевания и ответ на комбинированную антиретровирусную терапию у инфицированных пациентов, а также препятствует разработке вакцины против данного заболевания. Молекулярно-генетический анализ ВИЧ позволит отслеживать миграцию и мутации вируса, а также прогнозировать развитие эпидемии. Проведен сравнительный анализ нуклеотидной последовательности участка гена Env вариантов ВИЧ Республики Татарстан (г. Казань). Было обнаружено, что исследованные образцы ВИЧ из Республики Татарстан относятся к подтипу А.1 группы М штамма ВИЧ-1.

Благодарности

Работа выполнена в рамках Программы стратегического академического лидерства Казанского (Приволжского) федерального университета (Приоритет 2030).

Список литературы

  1. 1. World Health Organization [Electronic resource]. – Access mode: https://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/hiv-aids – Accessed: 25.05.2023.
  2. 2. Moir S., Chun T.-W., Fauci A.S. Pathogenic Mechanisms of HIV Disease // Annu. Rev. Pathol. Mech. Dis. – 2011. – Т. 6. №1. – С. 223–248.
  3. 3. Deeks S.G., Overbaugh J., Phillips A., Buchbinder S. HIV infection // Nat Rev Dis Primers. – 2015. – Т. 1. №1. – С. 15035.
  4. 4. Bbosa N., Kaleebu P., Ssemwanga D. HIV subtype diversity worldwide // Current Opinion in HIV and AIDS. – 2019. – Т. 14. №3. – С. 153–160.
  5. 5. ВИЧ-инфекция в Российской Федерации на 31 декабря 2021 г. // Специализированный научно-исследовательский отдел по профилактике и борьбе со СПИДом ФБУН Центрального НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора [Электронный ресурс]. – Режим доступа: http://www.hivrussia.info/wp-content/uploads/2022/03/Spravka-VICH-v-Rossii-na-31.12.2021-g..pdf (дата обращения: 25.05.2023).
  6. 6. Таишева Л.А. Оценка поведенческого риска ВИЧ-инфицирования среди молодежи / Л.А. Таишева // Казанский мед. ж. – 2009. – №3 [Электронный ресурс]. – Режим доступа: https://cyberleninka.ru/article/n/otsenka-povedencheskogo-riska-vich-infitsirovaniya-sredi-molodezhi (дата обращения: 25.05.2023).
  7. 7. Зайцева Н.Н., Парфенова О.В., Ефимов Е.И. Анализ распространенности резистентных штаммов ВИЧ к антиретровирусным препаратам в Приволжском федеральном округе // Вопросы вирусологии. – 2013. – №6 [Электронный ресурс]. – Режим доступа: https://cyberleninka.ru/article/n/analiz-rasprostranennosti-rezistentnyh-shtammov-vich-k-antiretrovirusnym-preparatam-v-privolzhskom-federalnom-okruge (дата обращения: 25.05.2023).
  8. 8. Sundquist W.I., Krausslich H.-G. HIV-1 Assembly, Budding, and Maturation // Cold Spring Harbor Perspectives in Medicine. – 2012. – Т. 2. №7. – С. a006924–a006924.
  9. 9. Zulfiqar H.F., Javed A., Sumbal, Afroze B., Ali Q., Akbar K., Nadeem T., Rana M., Nazar Z.A., Nasir I.A., Husnain T. HIV Diagnosis and Treatment through Advanced Technologies // Front. Public Health. – 2017. – Т. 5. – С. 32.
  10. 10. Singh P., Kaur G., Sharma G., Mehra N. K. Immunogenetic basis of HIV-1 infection, transmission and disease progression // Vaccine. – 2008. – Т. 26. №24. – С. 2966–2980.
  11. 11. Taylor B.S., Sobieszczyk M., McCutchan F., Hammer S. M. The Challenge of HIV-1 Subtype Diversity // N Engl J Med. – 2008. – Т. 358. №15. – С. 1590–1602.
  12. 12. Thomson M.M., Pérez-Álvarez L., Nájera R. Molecular epidemiology of HIV-1 genetic forms and its significance for vaccine development and therapy // The Lancet Infectious Diseases. – 2002. – Т. 2. №8. – С. 461–471.
  13. 13. Hemelaar J., Elangovan R., Yun J., Dickson-Tetteh L., Fleminger I., Kirtley S., Williams B., Gouws-Williams E., Ghys P. D., Abimiku A. G., Agwale S., Archibald C., Avidor B., Barbás M. G., Barre-Sinoussi F. Global and regional molecular epidemiology of HIV-1, 1990–2015: a systematic review, global survey, and trend analysis // The Lancet Infectious Diseases. – 2019. – Т. 19. №2. – С. 143–155.
  14. 14. Sarkhouh H., Chehadeh W. CODEHOP-Mediated PCR Improves HIV-1 Genotyping and Detection of Variants by MinION Sequencing // Microbiol Spectr. – 2021. – Т. 9. №2. – С. e01432–21.
  15. 15. Казеннова Е.В. Молекулярно-эпидемиологический анализ эпидемии ВИЧ-инфекции в Благовещенске и Хабаровске (Дальний Восток России) / Е.В. Казеннова, Д.А. Нешумаев, Д.В., Рукавицин // Вопросы вирусологии. – 2014. – №4 [Электронный ресурс]. – Режим доступа: https://cyberleninka.ru/article/n/molekulyarno-epidemiologicheskiy-analiz-epidemii-vich-infektsii-v-blagoveschenske-i-habarovske-dalniy-vostok-rossii (дата обращения: 25.05.2023).
  16. 16. Cao Z., Li J., Chen H., Song C., Shen Z., Zhou X., Lan G., Zhu Q., Liang S., Xing H., Liao L., Feng Y., Shao Y., Ruan Y. Effects of HIV-1 genotype on baseline CD4+ cell count and mortality before and after antiretroviral therapy // Sci Rep. – 2020. – Т. 10. №1. – С. 15875.
  17. 17. Gregson J., Tang M., Ndembi N., Hamers R. L., Rhee S., Marconi V. C., Diero L., Brooks K. A., Theys K., Rinke De Wit T., Arruda M., Garcia F., Monge S. Global epidemiology of drug resistance after failure of WHO recommended first-line regimens for adult HIV-1 infection: a multicentre retrospective cohort study // The Lancet Infectious Diseases. – 2016. – Т. 16. №5. – С. 565–575.
  18. 18. Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., Kumar S. MEGA6: Molecular evolutionary genetics analysis version 6.0 // Mol. Biol. Evol. – 2013. – 30. – P. 2725–2729.
  19. 19. Osmanov S., Pattou C., Walker N., Schwardländer B., Esparza J. Estimated Global Distribution and Regional Spread of HIV-1 Genetic Subtypes in the Year 2000 // JAIDS Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes. – 2002. – Т. 29. №2. – С. 184–190.

Комментарии(0)

При добавлении комментария укажите:
  • степень актуальности публикуемого материала;
  • общую оценку (оригинальность и актуальность темы, полнота, глубина, всесторонность раскрытия темы, логичность, связность, доказательность, структурная упорядоченность, характер и достоверность примеров, иллюстративного материала, убедительность выводов);
  • недостатки, недочеты;
  • вопросы и пожелания Автору.