Чув
Регистрация Вход
  1. Главная
  2. Конференция
  3. Фундаментальные и прикладные исследования по приор...
  4. Мультиплексная технология xMAP

Мультиплексная технология xMAP

Статья в сборнике трудов конференции
DOI: 10.31483/r-112104
Open Access
VII Всероссийская научно-практическая конференция «Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии»
Creative commons logo
Опубликовано в:
VII Всероссийская научно-практическая конференция «Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии»
Автор:
Антонова Е. И. 1 , Ачилов А. Б. 1 , Фирсова Н. В. 1 , Викторов Д. А. 1
Рубрика:
Молекулярная биология, генетика, микробиология
Страницы:
56-61
Получена: 28.05.2024

Рейтинг:
Статья просмотрена:
603 раз
Размещено в:
РИНЦ
1 Научно-исследовательский центр фундаментальных и прикладных проблем биоэкологии и биотехнологии ФГБОУ ВО «Ульяновский государственный педагогический университет им. И.Н. Ульянова»
Для цитирования:
Мультиплексная технология xMAP: сборник трудов конференции. / Е. И. Антонова, А. Б. Ачилов, Н. В. Фирсова, Д. А. Викторов // Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии : материалы VII Всерос. науч.-практич. конф. (Ульяновск, May 28, 2024) / editorial board: Е. И. Антонова [etc.] – Чебоксары: «Лару-тăру» («Среда») издательство çурчě, 2024. – pp. 56-61. – ISBN 978-5-907830-38-7. – DOI 10.31483/r-112104.

Аннотаци

В статье рассматриваются методы технологии xMAP, сфера применения в области клинических и фундаментальных исследований.

Благодарности

Статья написана и доклад выполнен в рамках Дополнительного соглашения №073-03-2024-060/1 от 13.02.2024 к Соглашению о предоставлении субсидии из федерального бюджета на финансовое обеспечение выполнения государственного задания на оказание государственных услуг (выполнения работ) №073-03-2024-060 от 18.01.2024, заключенным между ФГБОУ ВО «УлГПУ им. И.Н. Ульянова» и Министерством просвещения Российской Федерации.

Список литературы

  1. 1. Armstrong B., Stewart M., Mazumder A. Suspension arrays for high throughput, multiplexed single nucleotide polymorphism genotyping // Cytometry, 2000; 40: 102–108.
  2. 2. Boonhama N., Kreuze J., Winter S., van der Vlugt R., Bergervoet J., Tomlinsona J., Mumforda R. Methods in virus diagnostics: From ELISA to next generation sequencing // Virus Research 186 (2014) 20–31.
  3. 3. Cai H., White P.S., Torney D. Flow cytometry-based minisequencing: a new platform for high-throughput single-nucleotide polymorphism scoring. Genomics. 2000; 66: 135–143.
  4. 4. Chao O.X., Bing Z., Xuan S.Z, Jun P.S., Fen W.S., Cong H.W. [et.al.] Evaluation of Microsphere-based xMAP Test for gyrA Mutation Identification in Mycobacterium Tuberculosis // Biomedical and Environmental Sciences, 2023, 36 (4): 384–387. doi: 10.3967/bes2023.046
  5. 5. Chen J., Iannone M.A., Li M.S. A microsphere-based assay for multiplexed single nucleotide polymorphism analysis using single base chain extension. Genome Res. 2000; 10: 549–557.
  6. 6. Colinas R.J., Bellisario R., Pass K.A. Multiplexed genotyping of beta-globin variants from PCR-amplified newborn blood spot DNA by hybridization with allele-specific oligodeoxynucleotides coupled to an array of fluorescent microspheres. Clin Chem. 2000; 46: 996–998.
  7. 7. Cowan L.S., Diem L., Brake M.C., Crawford J.T. Transfer of a Mycobacterium tuberculosis genotyping method, spoligotyping, from a reverse line-blot hybridization, membrane-based assay to the Luminex multianalyte profiling system // Clin Microbiol. 2004; 42: 474–477.
  8. 8. Diaz M.R., Fell J.W. High-throughput detection of pathogenic yeasts of the genus Trichosporon // Clin Microbiol. 2004; 42: 3696–3706.
  9. 9. Dunbar S.A. Applications of Luminex® xMAP™ technology for rapid, high-throughput multiplexed nucleic acid detection // Clin Chim Acta., 2006, 363 (1): 71–82. DOI 10.1016/j.cccn.2005.06.023. EDN LNDLPB
  10. 10. Dunbar S.A., Jacobson J.W. Application of the Luminex LabMAP in rapid screening for mutations in the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator gene: a pilot study. Clin Chem. 2000; 46: 1498–1500.
  11. 11. Dunbar S.A., Vander Zee C.A., Oliver K.G., Karem K.L., Jacobson J.W. Quantitative, multiplexed detection of bacterial pathogens: DNA and protein applications of the Luminex LabMAP™ system // Microbiol Methods. 2003; 53: 245–252.
  12. 12. Fulton R.J., McDade R.L., Smith P.L., Kienker L.J., Kettman J.R., Jr. Advanced multiplexed analysis with the FlowMetrix™ system. Clin Chem. 1997; 43: 1749–1756.
  13. 13. Hadd A.G., Laosinchai-Wolf W., Novak C.R. Microsphere bead arrays and sequence validation of 5/7/9T genotypes for multiplex screening of cystic fibrosis polymorphisms. J Mol Diagn. 2004; 6: 348–355.
  14. 14. Iannone M.A., Taylor J.D., Chen J. Multiplexed single nucleotide polymorphism genotyping by oligonucleotide ligation and flow cytometry. Cytometry. 2000; 39: 131–140.
  15. 15. Iannone M.A., Taylor J.D., Chen J., Li M.S., Ye F., Weiner M.P. Microsphere-based single nucleotide polymorphism genotyping. Methods Mol Biol. 2003; 226: 123–134.
  16. 16. Johnson S.C., Marshall D.J., Harms G. Multiplexed genetic analysis using an extended genetic alphabet. Clin Chem. 2004; 50: 2019–2027.
  17. 17. Lee S.-H., Walker D.R., Cregan P.B., Boerma H.R. Comparison of four flow cytometric SNP detection assays and their use in plant improvement. Theor Appl Genet. 2004 (Nov. 17).
  18. 18. Montagnana M., Lippi G. Cancer diagnostics: current concepts and future perspectives. Ann Transl Med. 2017; 5 (13): 268.
  19. 19. Musher D., Goldsmith E., Dunbar S. The association between hypercoagulable states or increased platelet adhesion/aggregation and bacterial colonization of intravenous catheters. J Infect Dis. 2002; 186: 769–773.
  20. 20. Paradis F.W., Simard R., Gaudet D. Quantitative assay for the detection of the V617F variant in the Janus kinase 2 (JAK2) gene using the Luminex xMAP technology // BMC Medical Genetics. 2010. V. 11, 54.
  21. 21. Peterson A.W., Wolf L.K., Georgiadis R.M. Hybridization of mismatched or partially matched DNA at surfaces // Am Chem Soc. 2002; 124:14601–14607.
  22. 22. Pickering J.W., McMillin G.A., Gedge F., Hill H.R., Lyon E. Flow cytometric assay for genotyping Cytochrome P450 2C9 and 2C19: Comparison with a microelectronic DNA array. Am J Pharmacogenomics. 2004; 4: 199–207.
  23. 23. Pulumati A., Pulumati A., Dwarakanath B.S., Verma A., Papineni R.V.L. Technological advancements in cancer diagnostics: Improvements and limitations // Cancer Reports. 2023; 6: e1764. DOI 10.1002/cnr2.1764. EDN QXRNYI
  24. 24. Reslova N., Michna V., Kasny M., Mikel P., Kralik P. xMAP Technology: Applications in Detection of Pathogens // Front. Microbiol. 2017. V. 8. https://doi.org/10.3389/fmicb.2017.00055. EDN YXQOON
  25. 25. Spiro A., Lowe M. Quantitation of DNA sequences in environmental PCR products by a multiplexed, bead-based method. Appl Environ Microbiol. 2002; 68: 1010–1013.
  26. 26. Spiro A., Lowe M., Brown D. A bead-based method for multiplexed identification and quantitation of DNA sequences using flow cytometry. Appl Environ Microbiol. 2000; 66: 4258–4265.
  27. 27. Sung H., Ferlay J., Siegel R.L. [et al.] Global cancer statistics 2020: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA Cancer J Clin. 2021; 71 (3): 209–249.
  28. 28. Taniguchi H., Okamoto W., Muro K. [et al.] Clinical Validation of Newly Developed Multiplex Kit Using Luminex xMAP Technology for Detecting Simultaneous RAS and BRAF Mutations in Colorectal Cancer: Results of the RASKET-B Study // Neoplasia. 2018. V. 20. №12. P. 1219–1226.
  29. 29. Taylor J.D., Briley D., Nguyen Q. Flow cytometric platform for high-throughput single nucleotide polymorphism analysis. BioTechniques. 2001; 30: 661–669.
  30. 30. Tempany C.M.C., Jayender J., Kapur T. [et al.] Multimodal imaging for improved diagnosis and treatment of cancers. Cancer. 2015; 121 (6): 817–827.
  31. 31. Wallace J., Zhou Y., Usmani N. BARCODE-ALL: Accelerated and cost effective genetic risk-stratification in acute leukemia using spectrally addressable liquid bead microarrays. Leukemia. 2003; 17: 1404–1410.
  32. 32. Ye F., Li M.-S., Taylor J.D. Fluorescent microsphere-based readout technology for multiplexed human single nucleotide polymorphism analysis and bacterial identification. Hum Mutat. 2001; 17: 305–316.
  33. 33. Yoshino T., Muro K., Yamaguchi K., Nishina T., Denda T., Kudo T., Okamoto W., Taniguchi H., Akagi K., Kajiwara T., Hironaka S., Satoh T. Clinical Validation of a Multiplex Kit for RAS Mutations in Colorectal Cancer: Results of the RASKET (RAS KEy Testing) Prospective, Multicenter Study // EBioMedicine. 2015. 2. 317–323. DOI 10.1016/j.ebiom.2015.02.007. EDN WRSSYP

Комментарии(0)

При добавлении комментария укажите:
  • степень актуальности публикуемого материала;
  • общую оценку (оригинальность и актуальность темы, полнота, глубина, всесторонность раскрытия темы, логичность, связность, доказательность, структурная упорядоченность, характер и достоверность примеров, иллюстративного материала, убедительность выводов);
  • недостатки, недочеты;
  • вопросы и пожелания Автору.