Ру
Регистрация Вход
  1. Главная
  2. Конференция
  3. Фундаментальные и прикладные исследования по приор...
  4. Особенности генома штаммов Orthohantavirus puumala...

Особенности генома штаммов Orthohantavirus puumalaense, выявленных в Рыбно-Слободском районе Республики Татарстан

Статья в сборнике трудов конференции
DOI: 10.31483/r-111921
Open Access
VII Всероссийская научно-практическая конференция «Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии»
Creative commons logo
Опубликовано в:
VII Всероссийская научно-практическая конференция «Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии»
Авторы:
Насыров Т. Р. 1 , Давидюк Ю. Н. 2
Рубрика:
Молекулярная биология, генетика, микробиология
Страницы:
68-75
Получена: 23.05.2024

Рейтинг:
Статья просмотрена:
530 раз
Размещено в:
РИНЦ
1 Казанский (Приволжский) федеральный университет
2 Научно-клинический центр прецизионной и регенеративной медицины ФГАОУ ВО «Казанский (Приволжский) федеральный университет»
Для цитирования:

Аннотация

Проведены сравнительный и филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей отдельных сегментов генома штаммов Orthohantavirus puumlaense из Рыбно-Слободского района Республики Татарстан. Установлено, что исследованные штаммы наиболее близкородственны штаммам из Мамадышского района, вместе с ними образуют отдельную группу в Предкамье, варианты генома которой, вероятно, имеют гибридное происхождение.

Благодарности

Работа выполнена в рамках Программы стратегического академического лидерства Казанского (Приволжского) федерального университета (ПСАЛ–2030).

Список литературы

  1. 1. Blinova E. A fatal case of haemorrhagic fever with renal syndrome in Kursk Region, Russia, caused by a novel Puumala virus clade / E. Blinova, A. Deviatkin, S. Kurashova [et al.] // Journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases. – 2022. – V. 102. – A. 105295. DOI 10.1016/j.meegid.2022.105295. EDN NCOMTU
  2. 2. Blinova E. Evolutionary Formation and Distribution of Puumala Virus Genome Variants, Russia / E. Blinova, A. Deviatkin, M. Makenov [et al.] // Emerging infectious diseases. – 2023. – V. 29. – P. 1420–1424. DOI 10.3201/eid2907.221731. EDN BOADFE
  3. 3. Castel G. Phylogeography of Puumala orthohantavirus in Europe / G. Castel, F. Chevenet, M. Razzauti [et al.] // Viruses. – 2019. – V. 11. – A. 679. DOI 10.3390/v11080679. EDN YYRSDB
  4. 4. Davidyuk Y. Prevalence of the Puumala orthohantavirus Strains in the Pre-Kama Area of the Republic of Tatarstan, Russia / Y. Davidyuk, A. Shamsutdinov, E. Kabwe [et al.] // Pathogenes. – 2020. – Vol. 9. – Art. 540.
  5. 5. Davidyuk Y. The Distribution of Puumala orthohantavirus Genome Variants Correlates with the Regional Landscapes in the Trans-Kama Area of the Republic of Tatarstan / Y. Davidyuk, E. Kabwe, A. Shamsutdinov [et al.] // Pathogenes. – 2021. – V. 10. – A.1169.
  6. 6. Dekonenko A. Genetic similarity of Puumala viruses found in Finland and western Siberia and of the mitochondrial DNA of their rodent hosts suggests a common evolutionary origin / A. Dekonenko, V. Yakimenko, A. Ivanov [et al.] // Infection, genetics and evolution: journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases. – 2003. – V. 3. – P. 245–257. DOI 10.1016/S1567-1348(03)00088-1. EDN LHXOQX
  7. 7. Kabwe E. Analysis of Puumala orthohantavirus Genome Variants Identified in the Territories of Volga Federal District / E. Kabwe, W.Al Sheikh, A.F. Shamsutdinov [et al.] // Tropical Medicine and Infectious Disease. – 2022. – V.7,3. – A.46. DOI 10.3390/tropicalmed7030046. EDN OWBQNB
  8. 8. Kabwe E. Orthohantaviruses, Emerging Zoonotic Pathogens / E. Kabwe, Y. Davidyuk, A. Shamsutdinov [et al.] // Pathogens. – 2020. – V. 9. – A.775. DOI 10.3390/pathogens9090775. EDN VKOBXG
  9. 9. Kabwe E. Puumala Orthohantavirus Reassortant Genome Variants Likely Emerging in the Watershed / E. Kabwe, A.F. Shamsutdinov, S. Suleimanova [et al.] // Frontiers in bioengineering and biotechnology. – 2023. – V.24. – A.1018.
  10. 10. Kariwa H. Epidemiological study of hantavirus infection in the Samara Region of European Russia / H. Kariwa, E.A. Tkachenko, V.G. Morozov [et al.] // The Journal of veterinary medical science. – 2009. – V. 71. – P. 1569–1578. DOI 10.1292/jvms.001569. EDN MWWRJH
  11. 11. Martin D.P. RDP4: Detection and analysis of recombination patterns in virus genomes / D.P. Martin, B. Murrell, M. Golden [et al.] // Virus Evolution. – 2015. – V.1. – I.1.
  12. 12. Razzauti M. Analysis of Puumala hantavirus in a bank vole population in northern Finland: evidence for co-circulation of two genetic lineages and frequent reassortment between strains / M. Razzauti, A. Plyusnina, T. Sironen [et al.] // The Journal of general virology. – 2009. – V. 90. – P. 1923–1931. DOI 10.1099/vir.0.011304-0. EDN XXJCEK
  13. 13. Tamura K. Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees / K. Tamura, M. Nei // Molecular Biology and Evolution. – 1993. – V.10. – P. 512–526. EDN ITKNLD
  14. 14. Tamura K. MEGA11: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 11 / K. Tamura, G. Strecher, S. Kumar // Molecular Biology and Evolution. – 2021. – V.38. – P. 3022–3027.
  15. 15. Блинова Е.А. Генетические особенности вируса Пуумала (Hantaviridae: Orthohantavirus), обнаруженного в Московской области / Е.А. Блинова, М.Т. Макенов, Е.С. Морозкин [и др.] // Вопросы вирусологии. – 2023. – №68. – С. 283–290. DOI 10.36233/0507-4088-177. EDN NUUNOK
  16. 16. Елбоева П.И. Молекулярно-генетический анализ нуклеотидных последовательностей генома Puumala orthohantavirus, выявленных в Республике Мордовия / П.И. Елбоева, Ю.Н. Давидюк // Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии. – 2023. – С. 57–65. DOI 10.31483/r-106903. EDN WPSFEI
  17. 17. Краснов Я.М. Филогенетический анализ вариантов вируса Пуумала (Hantaviridae: Orthohantavirus), циркулирующих на территории Саратовской области / Я.М. Краснов, Е.В. Найденова, Н.П. Гусева [и др.] // Вопросы вирусологии. – 2024. – №69. – С. 162–174.
  18. 18. Насыров Т.Р. Анализ генома штаммов Puumala orthohantavirus, выявленных в Бавлинском районе Республики Татарстан / Т.Р. Насыров, Ю.Н. Давидюк // Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии. – 2023. – С. 74–80. DOI 10.31483/r-106792. EDN AREWFO
  19. 19. Савицкая Т.А. Хантавирусные болезни: обзор эпидемиологической ситуации в мире. Анализ эпидемиологической ситуации по геморрагической лихорадке с почечным синдромом в российской Федерации в 2023 г. и прогноз на 2024 г. / Т.А. Савицкая, А.В. Иванова, А.А. Зубова [и др.] // Проблемы особо опасных инфекций. – 2023. – №1. – С. 113–124.
  20. 20. Яшина Л.Н. Возбудитель вспышки ГЛПС в Саратовской области, 2019 г. / Л.Н. Яшина, Т.В. Трегубчак, Б.С. Малышев [и др.] // Проблемы особо опасных инфекций. – 2021. – №4. – С. 150–156. DOI 10.21055/0370-1069-2021-4-150-156. EDN DXXSEY

Комментарии(0)

При добавлении комментария укажите:
  • степень актуальности публикуемого материала;
  • общую оценку (оригинальность и актуальность темы, полнота, глубина, всесторонность раскрытия темы, логичность, связность, доказательность, структурная упорядоченность, характер и достоверность примеров, иллюстративного материала, убедительность выводов);
  • недостатки, недочеты;
  • вопросы и пожелания Автору.