Сравнительный анализ последовательности S-сегмента генома штаммов Puumala orthohantavirus, циркулирующих в ряде районов Республики Татарстан и Ульяновской области
Статья в сборнике трудов конференции
- Опубликовано в:
- V Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии»
- Автор:
- Кабве Э. 1 , Исаева Г. Ш. 1 , Князева А. В. 2 , Давидюк Ю. Н. 3
- Рубрика:
- Молекулярная биология, генетика, микробиология
- Страницы:
- 72-78
- Получена: 05.05.2022
- Рейтинг:
- Статья просмотрена:
- 1277 раз
- Размещено в:
- РИНЦ
- ГОСТ
Для цитирования:
Сравнительный анализ последовательности S-сегмента генома штаммов Puumala orthohantavirus, циркулирующих в ряде районов Республики Татарстан и Ульяновской области: сборник трудов конференции. / Э. Кабве, Г. Ш. Исаева, А. В. Князева, Ю. Н. Давидюк // Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии : материалы V Всерос. науч.-практич. конф. с международным участием (Ульяновск, May 20, 2022) / editorial board: Е. И. Антонова [etc.] – Чебоксары: «Лару-тăру» («Среда») издательство çурчě, 2022. – pp. 72-78. – ISBN 978-5-907561-33-5. – DOI 10.31483/r-102292.
DOI: 10.31483/r-102292
Аннотаци
Проведён сравнительный анализ нуклеотидной последовательности S-сегмента штаммов Puumala orthohantavirus из трёх локаций Предволжья Республики Татарстан и ряда локаций из Предкамья и Закамья Татарстана и двух районов Ульяновской области. Установлено, что штаммы из Предволжья Республики Татарстан филогенетически более родственны штаммам из Барышского района Ульяновской области, что свидетельствует о вероятном существовании на правом берегу Волги генетически обособленной группы штаммов вируса.
Финансовая поддержка | Номер гранта |
|---|---|
| Российский Фонд Фундаментальных Исследований | 19-34-60012 |
| Работа выполнена в рамках Программы стратегического академического лидерства Казанского (Приволжского) федерального университета и при финансовой поддержке РФФИ в рамках научного проекта 19-34-60012. | |
Список литературы
- 1. Иванис В.А. Геморрагическая лихорадка с почечным синдромом – проблема здравоохранения настоящего времени / В.А. Иванис, А.Ф. Попов, Г.С. Томилка, В.А. Фигурнов // Тихоокеанский медицинский журнал. – 2015. – №1. – С. 21–25.
- 2. Савицкая Т.А. Обзор хантавирусных инфекций в мире, эпидемиологической ситуации по геморрагической лихорадке с почечным синдромом в Российской Федерации в 2020 г. и прогноз на 2021 г. / Т.А. Савицкая, А.В. Иванова, Г.Ш. Исаева, И.Д. Решетников , Э. Кабве, В.А. Трифонов, В.Б. Зиатдинов, Д.В. Транквилевский, И.В. Серова, Н.В. Попов, О.Н. Скударева, И.В. Попова // Проблемы особо опасных инфекций. – 2021. – №2. – С. 62–70.
- 3. Castel G., Chevenet F., Razzauti M., Murri S., Marianneau P., Cosson J.-F., Tordo N., Plyusnin A. Phylogeography of Puumala orthohantavirus in Europe // Viruses. – 2019. – 11. – Art. 679.
- 4. Davidyuk Y., Shamsutdinov A., Kabwe E., Ismagilova R., Martynova E, Belyaev A., Shuralev E., Trifonov V., Savitskaya T., Isaeva G., Khaiboullina S., Rizvanov A., Morzunov S. Prevalence of the Puumala orthohantavirus Strains in the Pre-Kama Area of the Republic of Tatarstan, Russia // Pathogens. – 2020. – Vol. 9. – Art. 540.
- 5. Davidyuk Y.N., Kabwe E., Shamsutdinov A.F., Knyazeva A.V., Martynova E.V., Ismagilova R.K., Trifonov V.A., Savitskaya T.A., Isaeva G.S., Urbanowicz R.A., Khaiboullina S.F., Rizvanov A.A., Morzunov S.P. The Distribution of Puumala orthohantavirus Genome Variants Correlates with the Regional Landscapes in the Trans-Kama Area of the Republic of Tatarstan // Pathogens. – 2021. – 10. – Art. 1169.
- 6. Dekonenko A., Yakimenko V., Ivanov A., Morozov V., Nikitin P., Khasanova S., Dzagurova T., Tkachenko E., Schmaljohn C. Genetic similarity of Puumala viruses found in Finland and western Siberia and of the mitochondrial DNA of their rodent hosts suggests a common evolutionary origin // Inf. Gen. Evol. – 2003. – 3. – P. 245–257.
- 7. Kabwe E., Al Sheikh W., Shamsutdinov A.F., Ismagilova R.K., Martynova E.V., Ohlopkova O.V., Yurchenko Y.A., Savitskaya T.A., Isaeva G.S., Khaiboullina S.F., Rizvanov A.A., MorzunovS.P., Davidyuk Y.N. Analysis of Puumala orthohantavirus Genome Variants Identified in the Territories of Volga Federal District // Trop. Med. Infect. Dis. – 2022. – 7. – Art. 46.
- 8. Kariwa H., Tkachenko E.A., Morozov V.G., Seto T., Tanikawa Y., Kolominov S.I., Belov S.N., Nakamura I., Hashimoto N., Balakiev A.E. et al. Epidemiological Study of Hantavirus Infection in the Samara Region of European Russia // J. Vet. Med. Sci. – 2009. – 71 (12). – P. 1569–1578.
- 9. Kruger D.H., Figueiredo L.T.M., Song J.-W., Klempa B. Hantaviruses-Globally emerging pathogens. – J. Clin. Virol. – 2015. – 64. – P. 128–136.
- 10. Milholland M.T., Castro-Arellano I., Suzán G., Garcia-Peña G.E., Lee T.E., Rohde R.E., Aguirre A.A., Mills J.N. Global Diversity and Distribution of Hantaviruses and Their Hosts // EcoHealth. – 2018. – 15. – P. 163–208.
- 11. Mustonen J., Mäkelä S., Outinen T., Laine O., Jylhävä J., Arstila P.T., Hurme M., Vaheri A. The pathogenesis of nephropathia epidemica: New knowledge and unanswered questions // Antiviral Research. – 2013. – 100. – P. 589–604.
- 12. Plyusnin A., Vapalahti O., Vaheri A. Hantaviruses: genome structure, expression and evolution // J. of Gen. Virol. – 1996. – 77. – P. 2677–2687.
- 13. Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., Kumar S. MEGA6: Molecular evolutionary genetics analysis version 6.0 // Mol. Biol. Evol. – 2013. – 30. – P. 2725–2729.
Комментарии(0)