Давидюк Юрий Николаевич

проведён сравнительный анализ нуклеотидной последовательности S-сегмента штаммов Puumala orthohantavirus из трёх локаций Предволжья Республики Татарстан и ряда локаций из Предкамья и Закамья Татарстана и двух районов Ульяновской области. Установлено, что штаммы из Предволжья Республики Татарстан филогенетически более родственны штаммам из Барышского района Ульяновской области, что свидетельствует о вероятном существовании на правом берегу Волги генетически обособленной группы штаммов вируса.

диагностика и оценка кожных новообразований в большей части основана на гистопатологических критериях, тогда как в прогнозировании трансформации доброкачественных образований (невус) в меланому, а также в выявлении ранней стадии онкогенеза решающую роль играет оценка мутационного статуса пациента. Всесторонняя идентификация возможных прогностических биомаркеров экспрессируемых генов невус/меланома в полногеномных профилях позволит оценить злокачественный потенциал невуса и меланомы.

в статье проведён сравнительный и филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей S- и M-сегментов штаммов Puumala orthohantavirus из Бавлинского района Республики Татарстан. Установлено, что исследованные штаммы не имеют близкого родства с другими штаммами из Закамья Татарстана и, вероятно, могут относиться к отдельной группе штаммов, циркулирующих в бассейне реки Ик.

проведён молекулярно-генетический анализ нуклеотидных последовательностей участков S- и M-сегментов штаммов Puumala orthohantavirus, полученных из трех локаций Республики Мордовия. Установлено, что выявленные штаммы относительно наиболее близкородственны штаммам из Курской области. Полученные результаты дают основания предположить, что штаммы PUUV, циркулирующие в Курской области и выявленные в Республике Мордовия могут относится к отдельной сублинии в русской генетической линни вируса.

проведены сравнительный и филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей отдельных сегментов генома штаммов Orthohantavirus puumlaense из Рыбно-Слободского района Республики Татарстан. Установлено, что исследованные штаммы наиболее близкородственны штаммам из Мамадышского района, вместе с ними образуют отдельную группу в Предкамье, варианты генома которой, вероятно, имеют гибридное происхождение.

по результатам проведённого сравнительного и филогенетического анализа нуклеотидных последовательностей участков генома установлено, что штаммы Orthohantavirus puumalaense, циркулирующие в Туймазинском Районе Республики Башкортостан наиболее родственны штаммам, выявленным ранее в Бавлинском районе Республики Татарстан, и входят в генетически обособленную группу штаммов, распространённых в долине реки Ик и, возможно, являющихся реассортантами. Особенности генома штаммов из этих двух районов могут быть доказательством в пользу выдвинутой ранее гипотезы о независимой эволюции групп штаммов вируса...

проведен молекулярно-генетический анализ нуклеотидных последовательностей участков трех сегментов генома штаммов Orthohantavirus puumalaense (PUUV), выявленных у рыжих полёвок в Кировской области. Установлено, что штаммы принадлежат к сублинии East-FIN финской генетической линии PUUV.

в статье проведён сравнительный и филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей участков S-, M- и L-сегментов генома штаммов Orthohantavirus puumalaense, выявленных на территории Оренбургской области. У данных штаммов обнаружен новый вариант генома, возможно, относящийся к отдельной сублинии русской генетической линии вируса.

геморрагическая лихорадка с почечным синдромом (ГЛПС) остаётся одной из ведущих природно-очаговых инфекций в России, которая отличается выраженной клинической вариабельностью. Клинические проявления ГЛПС, в частности, могут быть обусловлены однонуклеотидными полиморфизмами (ОНП) в генах раннего иммунного ответа у пациентов. Нами было проведено определение частот аллелей и генотипов по ОНП в генах CASP1 (rs580253) и IL‑6 (rs1800795). При этом CASP1 кодирует каспазу-1 – фермент, являющийся продуктом активированной инфламмасомы, а IL‑6 кодирует интерлейкин 6 – цитокин острого иммунного ответа. Ус...

мультиэпитопные вакцины представляют собой перспективный инструмент профилактики вирусных инфекций, способный индуцировать комплексный гуморальный и клеточный иммунный ответ. В статье рассмотрены современные подходы к проектированию in silico химерных вакцинных конструкций: критерии отбора эпитопов, методы прогнозирования перспективных Т- и В-клеточных эпитопов, выбор линкеров и адъювантов, структурное моделирование, молекулярный докинг и симуляция иммунного ответа. Интеграция иммунноинформатических методов и молекулярного моделирования существенно ускоряет разработку вакцинных кандидатов и по...