в статье проведён сравнительный и филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей участков S-, M- и L-сегментов генома штаммов Orthohantavirus puumalaense, выявленных на территории Оренбургской области. У данных штаммов обнаружен новый вариант генома, возможно, относящийся к отдельной сублинии русской генетической линии вируса.
проведён молекулярно-генетический анализ нуклеотидных последовательностей участков S- и M-сегментов штаммов Puumala orthohantavirus, полученных из трех локаций Республики Мордовия. Установлено, что выявленные штаммы относительно наиболее близкородственны штаммам из Курской области. Полученные результаты дают основания предположить, что штаммы PUUV, циркулирующие в Курской области и выявленные в Республике Мордовия могут относится к отдельной сублинии в русской генетической линни вируса.
проведен молекулярно-генетический анализ нуклеотидных последовательностей участков трех сегментов генома штаммов Orthohantavirus puumalaense (PUUV), выявленных у рыжих полёвок в Кировской области. Установлено, что штаммы принадлежат к сублинии East-FIN финской генетической линии PUUV.
Hemorrhagic fever with renal syndrome (HFRS) remains one of the leading natural focal infections in Russia, characterized by pronounced clinical variability. Clinical manifestations of HFRS, in particular, may be determined by single nucleotide polymorphisms (SNPs) in early immune response genes in patients. We determined the allele and genotype frequencies of SNPs in the CASP1 (rs580253) and IL‑6 (rs1800795) genes. CASP1 encodes caspase‑1, an enzyme that is the product of the activated inflammasome, while IL‑6 encodes interleukin‑6, a cytokine of the acute immune response. It was found that t...
проведён сравнительный анализ нуклеотидной последовательности S-сегмента штаммов Puumala orthohantavirus из трёх локаций Предволжья Республики Татарстан и ряда локаций из Предкамья и Закамья Татарстана и двух районов Ульяновской области. Установлено, что штаммы из Предволжья Республики Татарстан филогенетически более родственны штаммам из Барышского района Ульяновской области, что свидетельствует о вероятном существовании на правом берегу Волги генетически обособленной группы штаммов вируса.
диагностика и оценка кожных новообразований в большей части основана на гистопатологических критериях, тогда как в прогнозировании трансформации доброкачественных образований (невус) в меланому, а также в выявлении ранней стадии онкогенеза решающую роль играет оценка мутационного статуса пациента. Всесторонняя идентификация возможных прогностических биомаркеров экспрессируемых генов невус/меланома в полногеномных профилях позволит оценить злокачественный потенциал невуса и меланомы.
в статье проведён сравнительный и филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей S- и M-сегментов штаммов Puumala orthohantavirus из Бавлинского района Республики Татарстан. Установлено, что исследованные штаммы не имеют близкого родства с другими штаммами из Закамья Татарстана и, вероятно, могут относиться к отдельной группе штаммов, циркулирующих в бассейне реки Ик.
проведены сравнительный и филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей отдельных сегментов генома штаммов Orthohantavirus puumlaense из Рыбно-Слободского района Республики Татарстан. Установлено, что исследованные штаммы наиболее близкородственны штаммам из Мамадышского района, вместе с ними образуют отдельную группу в Предкамье, варианты генома которой, вероятно, имеют гибридное происхождение.
по результатам проведённого сравнительного и филогенетического анализа нуклеотидных последовательностей участков генома установлено, что штаммы Orthohantavirus puumalaense, циркулирующие в Туймазинском Районе Республики Башкортостан наиболее родственны штаммам, выявленным ранее в Бавлинском районе Республики Татарстан, и входят в генетически обособленную группу штаммов, распространённых в долине реки Ик и, возможно, являющихся реассортантами. Особенности генома штаммов из этих двух районов могут быть доказательством в пользу выдвинутой ранее гипотезы о независимой эволюции групп штаммов вируса...
