En
Register Log in
  1. Main
  2. Conference
  3. Fundamental and applied research for key propriety...
  4. Novyi variant genoma Orthohantavirus puumalaense,...

Novyi variant genoma Orthohantavirus puumalaense, vyiavlennyi u shtammov virusa iz Tuimazinskogo raiona Respubliki Bashkortostan

Proceeding
DOI: 10.31483/r-111922
Open Access
All-Russian scientific conference with International Participation «Fundamental and applied research for key propriety areas of bioecology and biotechnology»
Creative commons logo
Published in:
All-Russian scientific conference with International Participation «Fundamental and applied research for key propriety areas of bioecology and biotechnology»
Authors:
Ruzilia K. Ismagilova 1 , Iurii N. Davidiuk 2
Work direction:
Молекулярная биология, генетика, микробиология
Pages:
61-68
Received: 23 May 2024

Rating:
Article accesses:
641
Published in:
РИНЦ
1 NIL Genetika mikroorganizmov, FGAOU VO "Kazanskii (Privolzhskii) federal'nyi universitet"
2 Nauchno-klinicheskii tsentr pretsizionnoi i regenerativnoi meditsiny FGAOU VO "Kazanskii (Privolzhskii) federal'nyi universitet"
For citation:
Ismagilova R. K., & Davidiuk I. N. (2024). Novyi variant genoma Orthohantavirus puumalaense, vyiavlennyi u shtammov virusa iz Tuimazinskogo raiona Respubliki Bashkortostan. Fundamental and applied research for key propriety areas of bioecology and biotechnology, 61-68. Чебоксары: PH "Sreda". https://doi.org/10.31483/r-111922

Abstract

По результатам проведённого сравнительного и филогенетического анализа нуклеотидных последовательностей участков генома установлено, что штаммы Orthohantavirus puumalaense, циркулирующие в Туймазинском Районе Республики Башкортостан наиболее родственны штаммам, выявленным ранее в Бавлинском районе Республики Татарстан, и входят в генетически обособленную группу штаммов, распространённых в долине реки Ик и, возможно, являющихся реассортантами. Особенности генома штаммов из этих двух районов могут быть доказательством в пользу выдвинутой ранее гипотезы о независимой эволюции групп штаммов вируса в популяциях рыжей полёвки в пределах отдельных речных долин.

Acknowledgments

Работа выполнена в рамках Программы стратегического академического лидерства Казанского (Приволжского) федерального университета (ПСАЛ–2030).

References

  1. 1. Елбоева П.И. Молекулярно-генетический анализ нуклеотидных последовательностей генома Puumala orthohantavirus, выявленных в Республике Мордовия / П.И. Елбоева, Ю.Н. Давидюк // Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии: сборник материалов VI Всерос. науч.-практ. конф. с международным участием (Ульяновск, 22 мая 2023 г.) / гл. ред. Е.И. Антонова; Ульяновский государственный педагогический университет им. И.Н. Ульянова. – Чебоксары: Среда, 2023. – 260 с. DOI 10.31483/r-106903. EDN WPSFEI
  2. 2. Краснов Я.М. Филогенетический анализ вариантов вируса Пуумала (Hantaviridae: Orthohantavirus), циркулирующих на территории Саратовской области / Я.М. Краснов, Е.В. Найденова, Н.П. Гусева [и др.]. // Вопросы вирусологии. – 2024. – Т. 6. №2. – С. 162–174.
  3. 3. Насыров Т.Р. Анализ генома штаммов Puumala orthohantavirus, выявленных в Бавлинском районе Республики Татарстан / Т.Р. Насыров, Ю.Н. Давидюк // Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии: сборник материалов VI Всерос. науч.-практ. конф. с международным участием (Ульяновск, 22 мая 2023 г.) / гл. ред. Е.И. Антонова; Ульяновский государственный педагогический университет им. И.Н. Ульянова. – Чебоксары: Среда, 2023. – 260 с. DOI 10.31483/r-106792. EDN AREWFO
  4. 4. Савицкая Т.А. Хантавирусные болезни: обзор эпидемиологической ситуации в мире. Анализ эпидемиологической ситуации по геморрагической лихорадке с почечным синдромом в Российской Федерации в 2023 г. и прогноз на 2024 г. / Т.А. Савицкая, А.В. Иванова, А.А. Зубова [и др.] // Проблемы особо опасных инфекций. – 2024. – №1. – С. 113–124. DOI 10.21055/0370-1069-2024-1-113-124. EDN WVTEWS
  5. 5. Blinova E., Deviatkin A., Kurashova S. [et al.] A fatal case of haemorrhagic fever with renal syndrome in Kursk Region, Russia, caused by a novel Puumala virus clade // Infect. Gen. Evol. – 2022. – Vol. 102. – Art. 105295. DOI 10.1016/j.meegid.2022.105295. EDN NCOMTU
  6. 6. Blinova E., Deviatkin A., Makenov M. [et al.] Evolutionary formation and distribution of Puumala virus genome variants, Russia. // Emerg. Inf. Dis. – 2023. – Vol.29, No7. – P. 1420–1424. DOI 10.3201/eid2907.221731. EDN BOADFE
  7. 7. Davidyuk Y., Shamsutdinov A., Kabwe E. [et al.] Prevalence of the Puumala orthohantavirus Strains in the Pre-Kama Area of the Republic of Tatarstan, Russia. // Pathogens. – 2020. – Vol. 9. – Art. 540. DOI 10.3390/pathogens9070540. EDN TMAUFS
  8. 8. Davidyuk Y.N., Kabwe E., Shamsutdinov A.F. [et al.] The Distribution of Puumala orthohantavirus genome variants correlates with the regional landscapes in the Trans-Kama area of the Republic of Tatarstan // Pathogens. – 2021. – Vol.10. – Art. 1169. DOI 10.3390/pathogens10091169. EDN NPFRJL
  9. 9. Dekonenko A., Yakimenko V., Ivanov A. [et al.] Genetic similarity of Puumala viruses found in Finland and western Siberia and of the mitochondrial DNA of their rodent hosts suggests a common evolutionary origin. // Inf. Gen. Evol. – 2003. – Vol. 3. – P. 245–257. DOI 10.1016/S1567-1348(03)00088-1. EDN LHXOQX
  10. 10. Kabwe E., Davidyuk Y., Shamsutdinov A. [et al.] Orthohantaviruses, Emerging Zoonotic Pathogens // Pathogens. – 2020. – Vol. 9. – Art. 775. DOI 10.3390/pathogens9090775. EDN VKOBXG
  11. 11. Kabwe E., Al Sheikh W., Shamsutdinov A.F. [et al.] Analysis of Puumala orthohantavirus genome variants identified in the territories of Volga federal district. // Trop. Med. Infect. Dis. – 2022. Vol. 7. – Art.46. DOI 10.3390/tropicalmed7030046. EDN OWBQNB
  12. 12. Pluysnin A., Vapalahti O., Vaheri A. Hantaviruses: genome structure, expression and evolution // J. Gen. Virol. – 1996. – Vol. 77. – P. 2677–2687. DOI 10.1099/0022-1317-77-11-2677. EDN LOMDBD
  13. 13. Razzauti M., Plyusnina A., Niemimaa J. [et al.] Co-circulation of two Puumala hantavirus lineages in Latvia: a Russian lineage described previously and a novel Latvian lineage // J. Med. Virol. – 2012. – Vol. 84. – P. 314–318. DOI 10.1002/jmv.22263. EDN XZWJYZ
  14. 14. Tamura K., Strecher G., Peterson D. [et al.] MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0. // Mol. Biol. Evol. – 2013. – Vol. 30. – P. 2725–2729.

Comments(0)

When adding a comment stipulate:
  • the relevance of the published material;
  • general estimation (originality and relevance of the topic, completeness, depth, comprehensiveness of topic disclosure, consistency, coherence, evidence, structural ordering, nature and the accuracy of the examples, illustrative material, the credibility of the conclusions;
  • disadvantages, shortcomings;
  • questions and wishes to author.