A new genetic variant of Orthohantavirus puumalaense identified in the Orenburg region

Proceeding
DOI: 10.31483/r-138904
Open Access
All-Russian scientific conference with International Participation «Fundamental and applied research for key propriety areas of bioecology and biotechnology»
Creative commons logo
Published in:
All-Russian scientific conference with International Participation «Fundamental and applied research for key propriety areas of bioecology and biotechnology»
Authors:
Iurii N. Davidiuk 1 , Daria A. Stepankova 2
Work direction:
Молекулярная биология, генетика, микробиология
Pages:
42-48
Received: 22 May 2025

Rating:
Article accesses:
109
Published in:
Информрегистр РИНЦ
1 Nauchno-klinicheskii tsentr pretsizionnoi i regenerativnoi meditsiny FGAOU VO "Kazanskii (Privolzhskii) federal'nyi universitet"
2 Kazan Federal University
For citation:
Davidiuk I. N., & Stepankova D. A. (2025). A new genetic variant of Orthohantavirus puumalaense identified in the Orenburg region. Fundamental and applied research for key propriety areas of bioecology and biotechnology, 42-48. Чебоксары: PH "Sreda". https://doi.org/10.31483/r-138904

Abstract

В статье проведён сравнительный и филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей участков S-, M- и L-сегментов генома штаммов Orthohantavirus puumalaense, выявленных на территории Оренбургской области. У данных штаммов обнаружен новый вариант генома, возможно, относящийся к отдельной сублинии русской генетической линии вируса.

Acknowledgments

Работа выполнена в рамках Программы стратегического академического лидерства Казанского (Приволжского) федерального университета (Приоритет 2030).

References

  1. 1. Blinova E. Evolutionary Formation and Distribution of Puumala Virus Genome Variants, Russia / E. Blinova, A. Deviatkin, M. Makenov [et al.] // Emerging infectious diseases. 2023. Vol. 29. Pp. 1420–1424. DOI 10.3201/eid2907.221731. EDN BOADFE
  2. 2. Castel G. Phylogeography of Puumala orthohantavirus in Europe / G. Castel, F. Chevenet, M. Razzauti [et al.] // Viruses. 2019. Vol. 11. P. 679. DOI 10.3390/v11080679. EDN YYRSDB
  3. 3. Dashian M.A. Genotypic differentiation and evolutionary dynamics of puumala orthohantavirus (PUUV) / M.A. Dashian, I.A. Volkhin, P.Y. Volchkov, A.A. Deviatkin // Acta Virol. 2024. Vol. 68. A. 13168. DOI 10.3389/av.2024.13168. EDN GQDONS
  4. 4. Deffontaine V. Beyond the Mediterranean Peninsulas: Evidence of Central European Glacial Refugia for a Temperate Forest Mammal Species, the Bank Vole (Clethrionomys Glareolus) / V. Deffontaine, R. Libois, P. Kotlík, R. Sommer, C. Nieberding, E. Paradis, J.B. Searle, J.R. Michaux // Mol. Ecol. 2005. Vol. 14. Pp. 1727–1739.
  5. 5. Kabwe E. Orthohantaviruses, Emerging Zoonotic Pathogens / E. Kabwe, Y. Davidyuk, A. Shamsutdinov [et al.] // Pathogens. 2020. Vol. 9. A.775. DOI 10.3390/pathogens9090775. EDN VKOBXG
  6. 6. Razzauti M. Microevolution of Puumala hantavirus in its host, the bank vole (Myodes glareolus): dis. M. Razzauti PhD; 24.02.12 / M. Razzauti, Haartman Insti-tute Faculty of Medicine. Helsinki, 2012. 88 l.
  7. 7. Tamura K. Estimation of the number of nucleotide substitutions in the con-trol region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees / K. Tamura, M. Nei // Molecular Biology and Evolution. 1993. Vol. 10. Pp. 512–526. EDN ITKNLD
  8. 8. Зырянов П.М. Обзор численности носителей и переносчиков зоонозов, эпизоотической и эпидемиологической обстановки в Приволжском федеральном округе в 2024 г. и прогноз на I полугодие 2025 г. / П.М. Зырянов, А.Н. Матросов, А.В. Иванова, Н.В. Попов; ФКУН «Российский противочумный институт «Микроб» Роспотребнадзора. – 2025. – 21 с.
  9. 9. Хантавирусные болезни: обзор эпидемиологической ситуации в мире. Анализ эпидемиологической ситуации по геморрагической лихорадке с почечным синдромом в Российской Федерации в 2023 г. и прогноз на 2024 г. / Т.А. Савицкая, А.В. Иванова, А.А. Зубова [и др.] // Проблемы особо опасных инфекций. – 2023. – №1. – С. 113–124.

Comments(0)

When adding a comment stipulate:
  • the relevance of the published material;
  • general estimation (originality and relevance of the topic, completeness, depth, comprehensiveness of topic disclosure, consistency, coherence, evidence, structural ordering, nature and the accuracy of the examples, illustrative material, the credibility of the conclusions;
  • disadvantages, shortcomings;
  • questions and wishes to author.