Чув
Регистрация Вход
  1. Главная
  2. Конференция
  3. Фундаментальные и прикладные исследования по приор...
  4. Новый вариант генома Orthohantavirus puumalaense,...

Новый вариант генома Orthohantavirus puumalaense, выявленный у штаммов вируса из Туймазинского района Республики Башкортостан

Статья в сборнике трудов конференции
DOI: 10.31483/r-111922
Open Access
VII Всероссийская научно-практическая конференция «Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии»
Creative commons logo
Опубликовано в:
VII Всероссийская научно-практическая конференция «Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии»
Автор:
Исмагилова Р. К. 1 , Давидюк Ю. Н. 2
Рубрика:
Молекулярная биология, генетика, микробиология
Страницы:
61-68
Получена: 23.05.2024

Рейтинг:
Статья просмотрена:
565 раз
Размещено в:
РИНЦ
1 НИЛ Генетика микроорганизмов, ФГАОУ ВО «Казанский (Приволжский) федеральный университет»
2 Научно-клинический центр прецизионной и регенеративной медицины ФГАОУ ВО «Казанский (Приволжский) федеральный университет»
Для цитирования:
Исмагилова Р. К. Новый вариант генома Orthohantavirus puumalaense, выявленный у штаммов вируса из Туймазинского района Республики Башкортостан: сборник трудов конференции. / Р. К. Исмагилова, Ю. Н. Давидюк // Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии : материалы VII Всерос. науч.-практич. конф. (Ульяновск, May 28, 2024) / editorial board: Е. И. Антонова [etc.] – Чебоксары: «Лару-тăру» («Среда») издательство çурчě, 2024. – pp. 61-68. – ISBN 978-5-907830-38-7. – DOI 10.31483/r-111922.

Аннотаци

По результатам проведённого сравнительного и филогенетического анализа нуклеотидных последовательностей участков генома установлено, что штаммы Orthohantavirus puumalaense, циркулирующие в Туймазинском Районе Республики Башкортостан наиболее родственны штаммам, выявленным ранее в Бавлинском районе Республики Татарстан, и входят в генетически обособленную группу штаммов, распространённых в долине реки Ик и, возможно, являющихся реассортантами. Особенности генома штаммов из этих двух районов могут быть доказательством в пользу выдвинутой ранее гипотезы о независимой эволюции групп штаммов вируса в популяциях рыжей полёвки в пределах отдельных речных долин.

Благодарности

Работа выполнена в рамках Программы стратегического академического лидерства Казанского (Приволжского) федерального университета (ПСАЛ–2030).

Список литературы

  1. 1. Елбоева П.И. Молекулярно-генетический анализ нуклеотидных последовательностей генома Puumala orthohantavirus, выявленных в Республике Мордовия / П.И. Елбоева, Ю.Н. Давидюк // Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии: сборник материалов VI Всерос. науч.-практ. конф. с международным участием (Ульяновск, 22 мая 2023 г.) / гл. ред. Е.И. Антонова; Ульяновский государственный педагогический университет им. И.Н. Ульянова. – Чебоксары: Среда, 2023. – 260 с. DOI 10.31483/r-106903. EDN WPSFEI
  2. 2. Краснов Я.М. Филогенетический анализ вариантов вируса Пуумала (Hantaviridae: Orthohantavirus), циркулирующих на территории Саратовской области / Я.М. Краснов, Е.В. Найденова, Н.П. Гусева [и др.]. // Вопросы вирусологии. – 2024. – Т. 6. №2. – С. 162–174.
  3. 3. Насыров Т.Р. Анализ генома штаммов Puumala orthohantavirus, выявленных в Бавлинском районе Республики Татарстан / Т.Р. Насыров, Ю.Н. Давидюк // Фундаментальные и прикладные исследования по приоритетным направлениям биоэкологии и биотехнологии: сборник материалов VI Всерос. науч.-практ. конф. с международным участием (Ульяновск, 22 мая 2023 г.) / гл. ред. Е.И. Антонова; Ульяновский государственный педагогический университет им. И.Н. Ульянова. – Чебоксары: Среда, 2023. – 260 с. DOI 10.31483/r-106792. EDN AREWFO
  4. 4. Савицкая Т.А. Хантавирусные болезни: обзор эпидемиологической ситуации в мире. Анализ эпидемиологической ситуации по геморрагической лихорадке с почечным синдромом в Российской Федерации в 2023 г. и прогноз на 2024 г. / Т.А. Савицкая, А.В. Иванова, А.А. Зубова [и др.] // Проблемы особо опасных инфекций. – 2024. – №1. – С. 113–124. DOI 10.21055/0370-1069-2024-1-113-124. EDN WVTEWS
  5. 5. Blinova E., Deviatkin A., Kurashova S. [et al.] A fatal case of haemorrhagic fever with renal syndrome in Kursk Region, Russia, caused by a novel Puumala virus clade // Infect. Gen. Evol. – 2022. – Vol. 102. – Art. 105295. DOI 10.1016/j.meegid.2022.105295. EDN NCOMTU
  6. 6. Blinova E., Deviatkin A., Makenov M. [et al.] Evolutionary formation and distribution of Puumala virus genome variants, Russia. // Emerg. Inf. Dis. – 2023. – Vol.29, No7. – P. 1420–1424. DOI 10.3201/eid2907.221731. EDN BOADFE
  7. 7. Davidyuk Y., Shamsutdinov A., Kabwe E. [et al.] Prevalence of the Puumala orthohantavirus Strains in the Pre-Kama Area of the Republic of Tatarstan, Russia. // Pathogens. – 2020. – Vol. 9. – Art. 540. DOI 10.3390/pathogens9070540. EDN TMAUFS
  8. 8. Davidyuk Y.N., Kabwe E., Shamsutdinov A.F. [et al.] The Distribution of Puumala orthohantavirus genome variants correlates with the regional landscapes in the Trans-Kama area of the Republic of Tatarstan // Pathogens. – 2021. – Vol.10. – Art. 1169. DOI 10.3390/pathogens10091169. EDN NPFRJL
  9. 9. Dekonenko A., Yakimenko V., Ivanov A. [et al.] Genetic similarity of Puumala viruses found in Finland and western Siberia and of the mitochondrial DNA of their rodent hosts suggests a common evolutionary origin. // Inf. Gen. Evol. – 2003. – Vol. 3. – P. 245–257. DOI 10.1016/S1567-1348(03)00088-1. EDN LHXOQX
  10. 10. Kabwe E., Davidyuk Y., Shamsutdinov A. [et al.] Orthohantaviruses, Emerging Zoonotic Pathogens // Pathogens. – 2020. – Vol. 9. – Art. 775. DOI 10.3390/pathogens9090775. EDN VKOBXG
  11. 11. Kabwe E., Al Sheikh W., Shamsutdinov A.F. [et al.] Analysis of Puumala orthohantavirus genome variants identified in the territories of Volga federal district. // Trop. Med. Infect. Dis. – 2022. Vol. 7. – Art.46. DOI 10.3390/tropicalmed7030046. EDN OWBQNB
  12. 12. Pluysnin A., Vapalahti O., Vaheri A. Hantaviruses: genome structure, expression and evolution // J. Gen. Virol. – 1996. – Vol. 77. – P. 2677–2687. DOI 10.1099/0022-1317-77-11-2677. EDN LOMDBD
  13. 13. Razzauti M., Plyusnina A., Niemimaa J. [et al.] Co-circulation of two Puumala hantavirus lineages in Latvia: a Russian lineage described previously and a novel Latvian lineage // J. Med. Virol. – 2012. – Vol. 84. – P. 314–318. DOI 10.1002/jmv.22263. EDN XZWJYZ
  14. 14. Tamura K., Strecher G., Peterson D. [et al.] MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0. // Mol. Biol. Evol. – 2013. – Vol. 30. – P. 2725–2729.

Комментарии(0)

При добавлении комментария укажите:
  • степень актуальности публикуемого материала;
  • общую оценку (оригинальность и актуальность темы, полнота, глубина, всесторонность раскрытия темы, логичность, связность, доказательность, структурная упорядоченность, характер и достоверность примеров, иллюстративного материала, убедительность выводов);
  • недостатки, недочеты;
  • вопросы и пожелания Автору.